ANAマイレージへのポイント移行手数料はカードごとに必要ですか?

いいえ、必要ありません。
例えば、ANAカードとANA VISA Suicaカードをお持ちで、いずれも「2倍コース」を申し込みされた場合、移行手数料は合計6,600円(税込)となります。